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脐橙嫁接选取砧木的时候首先需要考虑的问题就是亲和力，这是关乎嫁接后成活率的重要因素。除了亲缘关系之外，还需要注意砧木的根系生长情况，比较好选取根系发达的树木作为砧木，另外砧木比较好是适应性强，耐贫瘠、抗逆性强、能够大量繁殖的树木类型。而脐橙在嫁接的过程中比较常用到的砧木主要是枳、枳橙这两种树木。
枳树：枳树是最常用作柑橘类果树嫁接的砧木的树木，枳树具有抗病力强、成活率高、早结果、早丰产、耐寒、耐涝、耐旱等优良特点，非常适合脐橙树木作为砧木使用，并且小叶大花枳作为砧木的效果更好。
枳橙：枳橙从名字就能够看出来是枳树和橙子树的杂交树种，用枳橙作为砧木也能够起到很好的效果，和枳树相比，枳橙作为砧木的脐橙树具有树势强的特点，并且生长的速度快，更容易形成树冠等特点。
资阳香橙：除了上面提到的两种树木会经常用作脐橙的砧木之外，资阳香橙也经常会用作脐橙的砧木，资阳香橙这种砧木虽然相比枳树和枳橙作为砧木的脐橙树在结果时间上会稍微晚上一些时间，但是资阳香橙作为砧木的脐橙具有一个非常明显的优势就是后期结果量更加稳定，正是由于这个原因，现在四川、重庆等柑橘种植区近来正在大力的推广使用资阳香橙作为脐橙等柑橘类果树嫁接的砧木。
橙子树可以嫁接红心柚，柚子树芸香科常绿乔木。脐橙芸香科常绿小乔木。
橙子树嫁接红心柚成活的主要因素是接穗和砧木的亲和力，其次是嫁接的技术和管理。所谓的的亲和力就是接穗和砧木在内部组织结构上、生理和遗传上，彼此相同或相近，从而能互相结合在一起的能力。亲和力高，嫁接成活率也就高。
一般来说，植物的亲缘关系越近，则亲和力越强，嫁接就更容易成活。
柚子树和橙子树都是芸香科的同科树种，具有较强的亲缘关系，嫁接后的亲和力强，接穗容易愈合提高嫁接后的成活率。
嫁接脐橙用枳壳好，枳又名枳壳，是脐橙嫁接繁殖用的主要砧木。
脐橙嫁接时间通常是在早春和夏季，具体的月份是在二三月份和八九月份。进行嫁接的方法主要有芽接和枝接，首先要选取比较健康的枝条作为砧木，然后将它的切口削成尖形，最后进行嫁接即可。
脐橙砧木应选取亲和性强，嫁接成活率高；根系发达，生长迅速；且耐瘠薄，对当地气候、土壤有良好的适应性；抗逆性强，特别是对当地主要病虫害有较强的抵抗力；种子来源广，便于大量繁殖。脐橙常用砧木有枳和枳橙。
〖One〗、枳：枳又名枳壳，是脐橙嫁接繁殖用的主要砧木。属落叶性灌木或小乔木，叶片为3片小叶组成的掌状复叶。枳耐寒性极强，能耐-20℃低温。抗病力强，对脚腐病、衰退病、溃疡病和线虫病等有抵抗力。嫁接脐橙成活率高，表现早结果、早丰产，矮化或半娇化，耐寒、耐涝、耐旱，适于酸性土壤，但不耐盐碱。是良好的矮化脐橙砧，特别是小叶大花枳更佳
〖Two〗、枳橙：枳橙是枳与橙类的杂交种。属半落叶性小乔木，同株叶片有单身复叶和2~3片小叶组成的复叶，种子多胚。嫁接后树势强，根系发达，生长快，易形成树冠，早结丰产，而且耐旱、耐寒，抗脚腐病及衰退病。用枳橙作脐橙砧木，适应较宽的株行距，是稀植脐橙园采用的优良砧木。
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